MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae HS11286 plasmid pKPHS5

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016847	CAGGAT	2	12	148	159	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378976154
2	NC_016847	T	6	6	159	164	0 %	100 %	0 %	0 %	378976154
3	NC_016847	CCA	2	6	174	179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378976154
4	NC_016847	TGT	2	6	319	324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378976154
5	NC_016847	CAT	2	6	377	382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378976154
6	NC_016847	TAA	2	6	425	430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378976154
7	NC_016847	ACA	2	6	472	477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378976154
8	NC_016847	TAACT	2	10	484	493	40 %	40 %	0 %	20 %	378976154
9	NC_016847	ATC	2	6	505	510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378976154
10	NC_016847	GAC	2	6	524	529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378976154
11	NC_016847	GAG	2	6	606	611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378976155
12	NC_016847	CAT	2	6	634	639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378976155
13	NC_016847	ATCAAG	2	12	671	682	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	378976155
14	NC_016847	CAG	2	6	698	703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378976155
15	NC_016847	TGT	2	6	753	758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378976156
16	NC_016847	CTCA	2	8	824	831	25 %	25 %	0 %	50 %	378976156
17	NC_016847	GCG	2	6	857	862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378976156
18	NC_016847	GCAT	2	8	873	880	25 %	25 %	25 %	25 %	378976156
19	NC_016847	AGG	2	6	910	915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378976156
20	NC_016847	A	7	7	916	922	100 %	0 %	0 %	0 %	378976156
21	NC_016847	C	6	6	961	966	0 %	0 %	0 %	100 %	378976156
22	NC_016847	GTG	2	6	1000	1005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378976156
23	NC_016847	GGC	2	6	1049	1054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378976156
24	NC_016847	CAA	2	6	1555	1560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378976157
25	NC_016847	ATC	2	6	1644	1649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378976157
26	NC_016847	AAG	2	6	1688	1693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378976157
27	NC_016847	AAT	2	6	1765	1770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378976157
28	NC_016847	ATA	2	6	1781	1786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378976157
29	NC_016847	TCA	2	6	2024	2029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378976158
30	NC_016847	TCA	2	6	2069	2074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378976158
31	NC_016847	A	6	6	2142	2147	100 %	0 %	0 %	0 %	378976158
32	NC_016847	T	7	7	2182	2188	0 %	100 %	0 %	0 %	378976158
33	NC_016847	AAG	2	6	2207	2212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378976158
34	NC_016847	A	6	6	2237	2242	100 %	0 %	0 %	0 %	378976158
35	NC_016847	TCA	2	6	2255	2260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378976158
36	NC_016847	A	6	6	2345	2350	100 %	0 %	0 %	0 %	378976158
37	NC_016847	TTATA	2	10	2355	2364	40 %	60 %	0 %	0 %	378976158
38	NC_016847	TC	3	6	2397	2402	0 %	50 %	0 %	50 %	378976158
39	NC_016847	ATT	2	6	2416	2421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378976158
40	NC_016847	AAAG	2	8	2440	2447	75 %	0 %	25 %	0 %	378976158
41	NC_016847	AGCA	2	8	2523	2530	50 %	0 %	25 %	25 %	378976158
42	NC_016847	CTT	2	6	2552	2557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378976158
43	NC_016847	CTT	2	6	2561	2566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378976158
44	NC_016847	T	6	6	2619	2624	0 %	100 %	0 %	0 %	378976158
45	NC_016847	TCT	2	6	2660	2665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378976158
46	NC_016847	T	6	6	2668	2673	0 %	100 %	0 %	0 %	378976158

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.